Baganuur là điểm cuối một tuyến nhánh của đường sắt Xuyên Mông Cổ, và được nối với nhánh chính tại Bagakhangai. Do chi phí cao, đường sắt Mông Cổ đã dừng khai thác tuyến hành khách UB-Baganuur-UB, mặc dù vậy các đoàn tàu chở hàng như vận chuyển than tới thủ đô và các đô thị khác vẫn hoạt động. Từ trung tâm thủ đô, có thể đến Baganuur trên một tuyến đường 138 mới được hoàn thành năm 2004.lice Raid]</ref>